ITS(Internal Transcribed Spacer)鉴定是指对ITS序列进行DNA测序，通过将测序得到的ITS序列与已知真菌ITS序列比较，从而获得未知真菌种属信息的一种方法。
真核微生物的ITS序列既有结构与功能上的高度保守性，又有种属间高变性的特征。选择合适的通用引物对目标区域进行扩增、高通量测序。对其序列和丰度进行分析，可以有效分析出微生物群落结构组成、样本间的微生物种类及丰度差异，是微生物多样性研究的重要方法。
优势：测序读长长、结果准确率高、项目周期短，性价比高。
